明清时期的气功发展掀起了一个新的高潮：气功疗法为医家广泛接受，内丹术基本定型。另外，气功著作在此时期也大量出版。

医家李时珍的《奇经八脉考》不但论述了周天，而且肯定了练功与经络发现之间的关系；《张氏医通》对气功偏差提出了辨证论治，施以方药的思路；针灸学家杨继洲、温病大家叶天士都将气功和其他疗法综合应用于临床；张景岳的《类经》对气功的论述，包括理论与功法及其应用。

内丹术到了明代趋于成熟，功法逐渐定型，清代继续有所发展。张三丰的《玄机直讲》、伊真人的《性命圭旨》、陆西星的《金丹就正篇》等多部内丹著作相继问世，还出现了不少《周易参同契》《悟真篇》的注本。

（作者 孙琪年）