从目前形成的框架结构及今后的发展方向看，中医气功学的学术体系大体包括以下几个主要部分：

　　（1）基本理论：研究中医气功的发展历史、传统气功理论，以及建立在现代科学研究基础上的现代气功理论。全面、正确、系统地认识中医气功的发展历史探讨其起源、形成过程及发展规律，是继承和发扬中医气功学术的基础。故中医气功的史学研究不可或缺。中医气功的传统理论以阴阳五行、脏腑经络、气血津液、精气神等学说为主，并融入了一些道家、佛家的修炼理论。在学习这些理论学说的过程中，应注意中医基础理论在用于阐释气功学术时的变化与侧重；对于其他各家的气功理论，应注意取其精华、去其糟粕。另外，自20世纪80年代以来，现代科学对于气功进行了多学科的、从现象到机理的研究，其中生理、心理、物理、生化等方面的研究对于探讨中医气功的临床疗效与作用机理有重要作用，检验、评价、整理和应用这些已经取得的现代科学研究成果，并在此基础上进一步深入开拓，正是气功现代研究的任务。

　　（2）实践技能：气功的实践技能包括三调操作与气功功法。气功功法是气功学术承传的载体和基本方式，而三调操作是气功功法构成的基本要素。首先把握三调操作的基础，在学练各种功法时就能够提纲挈领，抓住重点，把握基本境界。故三调的基本操作是气功实践技能的基本功。在学习医学气功功法时，应全面了解其学术渊源、操作特点及临床应用，且以掌握三调合一的操作为中心。从古至今，各家各派的气功功法种类繁多，良莠不齐，故学习气功功法还应该注意去伪存真、去粗取精。本教材选取了10余种医学气功功法作为教学的主体，此外，在临床治疗部分还简要介绍了一些针对性比较强的选用功法。

　　（3）临床应用：中医气功的临床应用包括养生和治疗两部分，本教材主要探讨气功治疗的临床应用，养生问题拟另作专著，故基本未涉及。气功作为一种疗法在临床上与针灸、推拿并行。但气功疗法有其特殊性，中医的辩证施治原则须落实为因人施功与辩证施功，施治的过程包括教功、领功、查功，并强调发挥患者自身的主观能动性，故临床工作常规与中医的其他疗法既有联系又有区别。目前中医气功的临床治疗学术尚待发展，基本的临床治疗模式和规律还在探索之中。本教材的临床治疗部分包括了中医气功临床治疗的适用范围和工作常规，还介绍了多种疾病的辨治及气功处方。

　　（4）古典文献：气功古典文献是中医气功学发展的重要学术源泉。由于古代气功有不同的学术流派，古典气功文献也散见于中国传统文化许多领域。如医学、宗教、哲学、天文学、考古、历史乃至文学等古籍中均能查找到气功的内容，既有学术专著，也有章节片断。故气功古典文献的寻找、整理、评注、译释并非易事，而是长期和艰难的工作。气功文物的搜集与考证也属于这一领域。气功文献的发掘与整理应注意与当代信息科学的进步相联系，尽早尽快地利用电子计算机等现代信息工具。考虑到中医气功学课程的学时安排，本教材将这一部分内容列为附篇，其中节选的文献资料以古代医家气功为主，兼收各家，并予以注释，以方便自学。