根据民政部和学会《章程》的规定，经上级主管单位国家中医药管理局批准，由中国医学气功学会主办，河北省医疗气功医院承办的中国医学气功学会第五次会员代表大会暨2014学术年会，于2014年9月19-22日在北戴河河北省医疗气功医院召开。来自全国各地的163位会员代表参加会议。
19日晚上大会筹备组组织召开了第五次会员代表大会预备会议，就会议筹备的有关情况做了说明，并就下一步工作设想征求了大家的意见。国家中医药管理局直属机关党委常务副书记张为佳、人事教育司副司长金二澄、医政司主任科员王瑾出席了预备会。
20日上午，开幕式在中国医学气功学会副会长、河北省医疗气功医院副院长刘亚非主持下隆重举行。首届国医大师路志正，国家中医药管理局直属机关党委常务副书记张为佳、人事教育司副司长金二澄、医政司主任科员王瑾，中国中医药报社社长王淑军，北京中医药大学原校长龙致贤，北京中医药大学副校长王伟，河北省医疗气功医院院长王培芝，国家体育总局健身气功管理中心科研宣传部主任崔永胜等出席大会开幕式，在主席台就坐。
王培芝院长作了热情洋溢的欢迎辞,向与会代表简要介绍了河北省医疗气功医院的概况,并预祝大会圆满成功。
94岁高龄的国医大师路志正结合亲身经历，深情回顾了新中国成立后中医气功的发展历程，着重强调了中医气功的重要性，表示中医气功是中医药全面发展的重要组成部分，全面发展中医药不能少了中医气功，肯定了中国医学气功学会所做的工作成绩，“看到学会老、中、青三代人齐聚，说明中医气功有新发展”，同时也对学会的发展壮大和中医气功人才的培养寄予厚望。
张为佳常务副书记在讲话中充分肯定了中国医学气功学会多年来做出的积极贡献，并提出在国家大力推进经济结构调整、健康服务业发展及中医药事业大发展的背景下，医学气功事业迎来了难得的发展机遇。他希望学会和每位医学气功人坚持正确的政治方向，把握大局，顺应潮流，抓住机遇，要“学习、学习再学习”，既要学习政策，又要学习业务，学以致用，同时要注意团结，把不同的医学气功学术流派团结起来，要切实把发展祖国医学气功事业的重任承担起来，力争在推进中医治未病、防治慢性病等方面发挥医学气功的应有作用，拿出有说服力的证据，取得切实的成果。他希望新一届理事会要在广大会员的积极支持与协助下，勇于担当，齐心协力，把学会工作做好。
金二澄副司长讲话指出，学会在成立以来，在民政部和国家中医药管理局的领导与指导下，团结带领全国医学气功工作者和广大医学气功爱好者做了大量富有成效的工作，是一支在推动祖国医学气功事业不断发展壮大的道路上值得充分信赖、支持和依靠的社团组织和重要力量。国家中医药管理局将继续支持中国医学气功学会，围绕促进医学气功科学发展这一神圣职责，依法开展各类学术活动。鼓励和扶助学会充分发挥专业人才优势，切实承担起政府将要转变的部分职能，指导和帮助学会加强自身建设，提高组织管理能力；支持学会利用联系广泛、富有影响力的优势，更加有效地广泛宣传医学气功科普知识，让医学气功的科学健康内容深入人心，为促进中医药医疗保健服务和健康产业发展更好地发挥应有的作用；支持学会进一步加强医学气功科学研究，丰富中医药临床实践手段，开展形式多样、内容丰富的学术交流，促进国际间的医学气功交流与合作；努力探索解决好政策机制问题，为学会更好地依法组织开展各项工作营造更好的环境氛围。他要求学会要坚持依法按章办事，按照国家对社会团体管理的要求，进一步加强自身建设，健全权责明确、运转协调、制衡有效的学会法人管理结构，建立完善的议事、选举、财务、人事等内部制度。要逐步实现学会管理层的职业化和专业化，建设坚强有力的学会领导班子和过硬的工作队伍。学会必须要在继续模范地遵守国家法律法规及相关部门关于社团管理各项规定的同时，进一步拓宽思路、开拓创新，引领医学气功人才更好地发挥作用，不断拓展业务范围和提高临床疗效，不断提高学会的影响力和凝聚力，树立学会的良好形象，吸引更多的合格会员加入学会。他择要介绍了民政部和中央组织部等部门关于学会秘书长以上主要领导任职资格的相关要求，要求各位代表在选举中要把充分表达自己的意愿与按照章程规则和组织原则有机结合起来，依法选举出能够更好地促进学会工作、推动医学气功事业更加科学健康发展的领导人选，并希望学会能在新一届领导班子带领下，拓宽思路，团结一致，改革创新，推动学会各项工作取得突破，为中医药事业的发展和满足人民群众需求、维护人民健康，不断做出新的更大的贡献。
开幕式后，学会进行了换届选举。在民主有序的气氛中，与会会员代表根据学会《章程》的规定，按照程序选举产生了第五届理事会，第五届理事会选举产生了第五届常务理事会、秘书长、副会长、会长。北京中医药大学副校长王伟当选会长，北京中医药大学教授刘天君任常务副会长兼秘书长，河北省医疗气功医院副院长刘亚非、浙江中医药大学教授陈炳旗、中国中医药报社社长兼总编辑王淑军、江西中医药大学基础医学院及生命科学院院长章文春、中国人民解放军总医院健康医学中心主任医师黄孝宽任副会长。
选举结束后，常务副会长兼秘书长刘天君做了“中国医学气功学会第四届理事会工作报告”。报告首先从五个方面详细总结了学会五年来的工作，在学科建设方面，成功申报重点学科，牵头制定技术规范；在气功教学方面，编写出版规划教材，培训中医气功师资；在学术研讨方面，举办学术研讨会议，引领社会热点话题；在学科拓展方面，参与职业大典修订，传播气功经典功法；在组织建设方面，规范学会运作，通过财务审计。报告还介绍了本次大会及换届工作的筹备经过，并对下一届理事会的工作提出了几点建议，建议新一届理事会大力促进医学气功朝着实行资格准入、持证上岗的方向迈进，并组织更加多样化和不同层次的医学气功学术活动，与各级医院挂勾，建立科研和临床基地，加强国际合作，加快医学气功走向世界的步伐。与会代表对学会5年来的工作给予了高度肯定，热烈鼓掌通过了这个工作报告。
新当选会长王伟发表了热情洋溢的讲话，指出作为学会的挂靠单位，北京中医药大学将一如既往地支持学会的工作。他强调，在当前信息化建设和健康产业迅速发展的历史转型时期，中国医学气功学会要把握新的历史机遇，并对学会工作提出了三点要求，一是以学为本、突出学术。学会要本着学术第一的要求，突出学术特征，做好学术工作。首先要做好医学气功的传承工作，各个医学气功学派要静下心、沉下气，认真梳理挖掘医学气功的理论与方法，既不能轻易否定，也不能贸然确认，要本着科学的态度，将广大院校的人士和民间的人士结合起来，形成有力的团队，共同继承好优秀历史文化遗产。其次，要狠抓科学研究。要本着严谨求实、认真负责、实事求是的科学精神，在明确医学气功现象与事实的基础上，运用现代多学科的先进技术与方法，研究其背后的科学规律。希望每位会员都勇于担当，认真思考，提出有价值的选题，学会将帮助大家整合资源，协同攻关。再者，要搞活应用。把医学气功纳入医疗体系和健康产业，通过主渠道积极推广医学气功，充分发挥其养生治病效果，切实服务民众，让民众感受到医学气功的益处。二是要解放思想，更新观念，开放包容。学会要百花齐放、百家争鸣，不同的学术流派不能互相诋毁，要相互包容，和而不同，从有利于学会和医学气功事业发展的角度，彼此容纳，相互促进，协同提高。三是要依法办事，按章管理。学会要按照国家法律法规和学会章程的规定，坚决抵制国内外各种敌对势力、邪教、有害气功和其他不法分子的活动，坚决杜绝其混入学会。新一届理事会要正确引领医学气功学会的会员，把握好正确的意识形态，在医学气功领域积极践行社会主义核心价值观。最后，王会长希望新一届理事会成员要与全体会员一道，携手并进，同心同德，推动学会的各项工作再上一个新台阶。
接下来，会议听取了关于中国医学气功学会《章程》修订的说明，表决通过了修改后的学会《章程》。
20日下午和21日全天举行了2014年学术年会。本次年会共收到学术论文105篇，本着科学严谨的原则，选取其中88篇收录到论文集中，内容涵盖医学气功的发展、教育、理论、科研、功法、临床6大方面，并专门开辟了大学生论坛，录用高校大学生的10余篇论文，为医学气功增添了新生力量，预示着医学气功事业后继有人。此次年会共安排5场学术交流活动，20余篇论文做了大会交流，并组织了近10种功法的演示。河北省医疗气功医院副院长刘亚非作了《刘贵珍与气功疗法治论著篇（1954年-1965年）》的报告，上海市气功研究所教授葛林宝作了《关于医学气功诊疗规范的几点思考》的报告，北京中医药大学博士后张海波作了《加强中医气功学科建设的几点思考》的报告，湖南省社会科学研究院研究员唐光斌作了《气功文化发展的SWOT分析》的报告，上海浦江教育出版社副社长黄健作了《近五年医学气功期刊论文述评》的报告，江西中医药大学基础医学院及生命科学院院长章文春作了《气功科学三层物质理论探析》的报告，北京中医药大学副教授魏玉龙作了《意境作业诱发安神解郁作用的功率谱反应与分子效应》的报告，河南中医学院教授翟向阳作了《禅修与其模拟安静态脑电分析中差值的功率谱分析》的报告，天津中医药研究院附属医院主任张福顺作了《医疗气功的临床指导体会》的报告，江西中医药大学许铮作了《气功外气抑制乳腺癌细胞生长的比较研究》的报告，中国人民解放军总医院主任医师黄孝宽演示了中华天元养生气功，河北省医疗气功医院副院长刘亚非演示了内养功……这些论文交流和功法演示，充分展示了医学气功当前的学科发展水平以及医学气功功法的魅力，得到与会代表的一致好评。
21日下午，学术交流结束后，刘天君常务副会长兼秘书长进行了大会总结。他指出，来自上级领导和中医界前辈的肯定、支持和鼓励，使与会代表倍感振奋，深受鼓舞，并将激励每一位医学气功从业者不断学习，奋勇前进。新一届学会领导和理事会成员将在党的十八大和十八届三中全会精神指引下，以身作则，从我做起，全心全意推动中国医学气功学会的各项工作，引导全体会员把握医学气功发展的大好机遇，刻苦钻研，潜心研究，包容创新，为中国医学气功事业的繁荣、祖国医药卫生事业的发展和中华民族伟大复兴中国梦的早日实现做出应有的更大的贡献。最后，他宣布，中国医学气功学会第五次会员代表大会暨2014年学术年会胜利闭幕。